Jednog prohladnog decembarskog jutra 1957, u knjižaru „Sempere i sinovi" ušao je tajanstveni čovek zlokobnog izgleda, kupio primerak Grofa Monte Krista i u njemu ostavio neobičnu poruku za Fermina Romera de Toresa. Danijel Sempere, uznemiren pojavom tog neznanca, počinje da istražuje kakve niti povezuju njega i njegovog najboljeg prijatelja. Pred njim se razotkriva jedno mračno razdoblje Ferminove prošlosti i njegova veza s Davidom Martinom, neobičnim piscem čija se životna sudbina preplitala s Danijelovom a da ovaj toga nije ni bio svestan. Otkrivajući detalje te priče, Danijel će doći do zastrašujućeg saznanja o prošlosti svoje porodice, koje će ga uzdrmati i zauvek promeniti kao čoveka.
Zatočenik Nebesa pripada ciklusu o Groblju zaboravljenih knjiga, koji zasad sačinjavaju još i Senka vetra i Igra anđela, dve knjige koje spadaju u najčitanije i najcenjenije knjige savremene španske proze. Romani ovog ciklusa međusobno su povezani likovima i sižejnim nitima, ali svaki od njih nudi i završenu nezavisnu priču.
Zatočenik Nebesa hronološki se odvija nakon Senke vetra, ali bavi se i događajima koji su se odigrali ranije, bacajući novo svetlo na zaplet i likove iz prethodna dva romana.